| Program | Division | Department | |
| Programs for Biomedical Research （創生医科学専攻） |
Division of Molecular Medical Science |
Integrative Bioscience | 統合バイオ |
| Cardiovascular Physiology and Medicine | 心臓血管生理医学 | ||
| Biomedical Chemistry | 医化学 | ||
| Virology | ウイルス学 | ||
| Immunology | 免疫学 | ||
| Dermatology | 皮膚科学 | ||
| Biomaterials Science | 生体材料学 | ||
| Dental and Medical Biochemistry | 口腔生化学 | ||
| Oral Biology | 口腔細胞生物学 | ||
| Bacteriology | 細菌学 | ||
| Physiological Chemistry | 生理化学 | ||
| Division of Integrated Medical Science （病態探究医科学講座） |
Anatomy and Developmental Biology | 解剖学及び発生生物学 | |
| Neurophysiology | 神経生理学 | ||
| molecular and pharmacological neuroscience | 神経薬理学 | ||
| Clinical Neurosciences and Therapeutics | 脳神経内科学 | ||
| Oral Physiology | 口腔生理学 | ||
| Dental Pharmacology | 歯科薬理学 | ||
| Xenobiotic Metabolism and Molecular Toxicology | 生体機能分子動態学 | ||
| Cellular and Molecular Biology | 細胞分子生物学 | ||
| Biochemical Genetics | 遺伝生化学 | ||
| Cytogenetics | 細胞遺伝学 | ||
| Division of Frontier Medical Science （先進医療開発科学講座） |
Medicine and Molecular Science | 分子病態制御内科学 | |
| Psychiatry and Neurosciences | 精神神経医科学 | ||
| Surgery | 外科学 | ||
| Neurosurgery | 脳神経外科学 | ||
| Urology | 腎泌尿器科学 | ||
| Ophthalmology and Visual Science | 視覚病態学 | ||
| Oral Maxillofacial Pathobiology | 口腔顎顔面病理病態学 | ||
| Periodontal Medicine | 歯周病態学 | ||
| Molecular Oral Medicine & Maxillofacial Surgery | 分子口腔医学・顎顔面外科学 | ||
| Analytical Molecular Medicine and Devices | 分子治療デバイス学 | ||
| Molecular Microbiology and Biotechnology | 遺伝子制御科学 | ||
| Clinical Oncology | がん治療学 | ||
| Medical Science in Gastrointestinal Endoscopy | 内視鏡診療科 | ||
| (独)理化学研究所 脳科学総合研究センター 神経・精神病態制御学 |
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| Division of Genome Radiobiology and Medical Science （放射線ゲノム医科学講座） |
Biochemistry | 分子細胞情報学 | |
| Molecular Pathology | 分子病理学 | ||
| Radiation Oncology | 放射線腫瘍学 | ||
| Cellular Biology | 細胞修復制御 | ||
| Molecular Radiobiology | 放射線細胞応答 | ||
| Disease Model | 疾患モデル解析 | ||
| Radiation Biology | 放射線ゲノム疾患 | ||
| Human Genetics | ゲノム障害病理 | ||
| Molecular Oncology | がん分子病態 | ||
| Experimental Oncology | 分子発がん制御 | ||
| Stem Cell Biology | 幹細胞機能学 | ||
| Radiation Medicine | 放射線医療開発 | ||
| Hematology and Oncology | 血液・腫瘍内科 | ||
| Surgical Oncology | 腫瘍外科 | ||
| (独)放射線医学総合研究所 重粒子医科学・分子イメージング | |||
| (独)放射線医学総合研究所放射線防護・緊急被ばく医療 | |||
| Programs for Applied Biomedicine （展開医科学専攻） |
Division of Medical Intelligence and Informatics （病態情報医科学講座） Clinical Studies |
Pathology | 病理学 |
| Epidemiology,Infectious Disease Control and Prevention | 疫学・疾病制御学 | ||
| Public Health and Health Policy | 公衆衛生学 | ||
| Forensic Medicine | 法医学 | ||
| Pediatrics | 小児科学 | ||
| Cardiovascular Medicine | 循環器内科学 | ||
| Diagnostic Radiology | 放射線診断学 | ||
| Mucosal Immunology | 粘膜免疫学 | ||
| Oral and Maxillofacial Radiology | 歯科放射線学 | ||
| Medical Informatics and Systems Management | 医療情報部 | ||
| Infectious Diseases | 感染症科 | ||
| Epidemiology | 分子疫学 | ||
| Environmetrics and Biometrics | 計量生物 | ||
| Radiation Biophysics | 線量測定・評価 | ||
| Radiation Information Registry | 附属被ばく資料調査解析部 | ||
| Epidemiology | (財)放射線影響研究所 放射線生物学・分子疫学部 | ||
| Clinical Studies | (財)放射線影響研究所 疫学部 | ||
| Division of Clinical Medical Science （病態制御医科学講座） Natural Science Center for Basic Research and Development |
Molecular and Internal Medicine | 分子内科学 | |
| Surgery | 外科学 | ||
| Obstetrics and Gynecology | 産科婦人科学 | ||
| Orthopaedic Surgery | 整形外科学 | ||
| Otorhinolaryngology , Head and Neck Surgery | 耳鼻咽喉科学・頭頸部外科学 | ||
| Anesthesiology and Critical Care | 麻酔蘇生学 | ||
| Oral Growth and Developmental Biology | 口腔成長・発達生物学 | ||
| Dental Anesthesiology | 歯科麻酔学 | ||
| Clinical Immunology and Rheumatology | リウマチ・膠原病科 | ||
| Rehabilitation Medicine | リハビリテーション科 | ||
| Natural Science Center for Basic Research and Development | 自然科学研究支援開発センター | ||
| Division of Cervico-Gnathostomatology （顎口腔頚部医科学講座） |
Dental Science for Health Promotion | 健康増進歯学 | |
| Advanced Prosthodontics | 先端歯科補綴学 | ||
| Oral and Maxillofacial Surgery | 口腔外科学 | ||
| Orthodontics and Craniofacial Developmental Biology | 歯科矯正学 | ||
| Pediatric Dentistry | 小児歯科学 | ||
| General Dentistry | 口腔総合診療科 | ||
| Division of Clinical Pharmacotherapeutics （病態薬物治療学講座） |
Clinical Pharmacotherapy | 臨床薬物治療学 | |
| Pathophysiology and Therapeutics | 病態解析治療学 | ||
| Pharmacotherapy | 治療薬効学 | ||
| Emergency and Critical Care Medicine | 救急医学 | ||
| General Medicine | 総合内科・総合診療科 | ||
Programs for Pharmaceutical Sciences （薬学専攻） |
Division of Medicinal Chemistry （創薬科学講座） |
Pharmacognosy | 生薬学 |
| Functional Molecular Sciences | 医薬分子機能科学 | ||
| Synthetic Organic Chemistry | 創薬合成化学 | ||
| Division of Clinical Pharmaceutical Science （医療薬学講座） |
Pharmacology | 薬効解析科学 | |
| Pharmaceutics and Therapeutics | 医療薬剤学 | ||
| Pharmaceutical Services | 薬剤部 | ||
| Master's Program for Oral Health Sciences （口腔健康科学専攻） |
Division of Oral Health Sciences （口腔健康科学講座） |
Public Oral Health | 公衆口腔保健学 |
| Maxillofacial Functional Development | 口腔発達機能学 | ||
| Oral Health Management | 口腔保健管理学 | ||
| Anatomy and Functional Restorations | 生体構造・機能修復学 | ||
| Medical System and Biomaterial Engineering | 医療システム・生体材料工学 | ||
| Oral Biology & Engineering | 口腔生物工学 | ||
| Contributed Chair （寄附講座） |
Artificial Joints and Biomaterials | 人工関節・生体材料学 | |
| Advanced Nephrology | 腎臓病制御学 |