1）海を舞台に展開する「生命のドラマ」のうち、微生物を主人公としたストーリーを読み解きます。目にみえないほど小さな微生物ですが、生態系における役割は巨大です。排泄物や遺骸、食べ残しなどを分解する「環境のおそうじ」役、そして、他の生物が食べられないほど微小な有機物を食べて増えつつ、自分が他の生物に食べられることで実質的な「生産者」としての役割を果たしています。大きな海の小さな生きものが面白いのです。

2）有害藻類の出現・増殖予知技術の開発と、サンゴに共生する褐虫藻の研究を行っています。前者においては、赤潮原因藻の出現を効率よくモニタリングする手法・機器の開発、また、光合成活性を指標とした増殖予知技術の開発にも力を注いでいます。後者に関しては、サンゴがどのように褐虫藻を認識して共生を開始するのか、そして、それがどのような要因で崩壊するのか（サンゴの白化）、フィールド調査（沖縄）や水槽実験などを用いてアプローチしています（小池）。
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プランクトン，クラゲ，サンゴ，微細藻類，微生物，食物連鎖，生物多様性

微生物のヤブレツボカビ（T）と繊毛中（C)

サンゴ礁においてスキューバダイビングで調査を実施

Ryosuke Nakai, Takatomo Fujisawa, Yasukazu Nakamura, Tomoya Baba, Miyuki Nishijima, Fatma Karray, Sami Sayadi, Hiroko Isoda, Takeshi Naganuma & Hironori Niki (2016) Genome sequence and overview of Oligoflexus tunisiensis Shr3T in the eighth class Oligoflexia of the phylum Proteobacteria. Standards in Genomic Science, 11:90, DOI: 10.1186/s40793-016-0210-6.

Akio Ueno, Satoru Shimizu, Shuji Tamamura, Hidetoshi Okuyama, Takeshi Naganuma & Katsuhiko Kaneko (2016) Anaerobic decomposition of humic substances by Clostridium from the deep subsurface. Scientirfic Reports, 6, Article number 18990. DOI: 10.1038/srep18990

Ryosuke Nakai, Tomoya Baba, Hironori Niki, Miyuki Nishijima & Takeshi Naganuma (2015) Aurantimicrobium minutum gen. nov., sp. nov., a novel ultramicrobacterium of the family Microbacteriaceae, isolated from river water. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 65, 4072-4079. DOI:10.1099/ijsem.0.000541

Ryosuke Nakai, Miyuki Nishijima, Nozomi Tazato, Yutaka Handa, Fatma Karray, Sami Sayadi, Hiroko Isoda & Takeshi Naganuma (2014) Oligoflexus tunisiensis gen. nov., sp. nov., a Gram-negative, aerobic, filamentous bacterium of a novel proteobacterial lineage, and description of Oligoflexaceae fam. nov., Oligoflexales ord. nov. and Oligoflexia classis nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 64, 3353-3359; DOI: 10.1099/ijs.0.060798-0 【COVER PHOTO】

Su-Myat, Maung-Saw-Htoo-Thaw, Matsuoka K, Khin-Ko-Lay, Koike K. (2012) Phytoplankton surveys off the southern Myanmar coast of the Andaman Sea: an emphasis on dinoflagellates including potentially harmful species. Fish. Sci. DOI: 10.1007/s12562-012-0534-0

Escalera L, Reguera B, Takishita K, Yoshimatsu S, Koike K, Koike K. (2011) CyanobacterialEndosymbionts in the Benthic DinoflagellateSinophysiscanaliculata (Dinophysiales, Dinophyceae). Protist,162: 304-314.

Yamashita H, Suzuki G, Hayashibara T, Koike K. (2011) Do corals select zooxanthellae by alternative discharge? Mar. Biol. 158:87-100.

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教授　長沼 毅     
教授　小池 一彦