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【研究成果】新しい「門」ブデロビブリオノータなどの提案~細菌の類縁関係の全面的見直しによる新発見~

本研究成果のポイント

  • 細菌の類縁関係を大規模に解析し、4つの新しい「門(※1)」を提案した。
  • 細菌の分類において最上位の階級「門」の提案は、世界的に極めて重要である。
  • 今後、関連微生物を同定する際に、この新「門」が比較・照合する新基準となる。

概要

広島大学大学院統合生命科学研究科の長沼毅教授は、国立研究開発法人産業技術総合研究所生物プロセス研究部門の中井亮佑研究員(平成24年3月 広島大学大学院生物圏科学研究科 博士課程後期を修了)、オークランド大学のDavid W. Waite研究員、クイーンズランド大学のPhilip Hugenholtz教授らを含む国際共同研究グループと共同で、細菌の中で巨大なプロテオバクテリア門内の微生物などを大規模に解析して再編成し、4つの新しい「門」(新門)の分類群を提案した。「門」の階級は、細菌の分類体系において最も上位の階級にあたる。

長沼教授と中井研究員は、2014年にサハラ砂漠の調査で新種の微生物を発見した。その微生物はプロテオバクテリア「門」に属するものの、既存の分類群にまったくあてはまらなかったため、「綱」レベルで新しい分類群(オリゴフレキシア綱)を提案した(参考資料および2014年10月2日広島大学プレス発表)。その後、細菌のDNA情報などが拡充してきたことと、オリゴフレキシア綱やその関連分類群(デルタプロテオバクテリア綱やサーモデスルフォバクテリア門)の類縁関係が度々議論されてきたことなどから、国際チームで全面的な検討が行われ、ブデロビブリオノータ新門を含む複数の分類階級を提案するに至った。

今回の研究成果は、英国の科学雑誌「International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM)」のオンライン版に掲載された。現在、細菌の学名がまとめられているデータベース(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature; LPSN)にはおよそ35の門(暫定の門を除く)が載っており、ここへ新たに4つの門が加わる。新しい学名を記載するIJSEMにおいて、今回のような4つの新門の同時提案が受理されることは極めて珍しい。

(図) 今回の全面的な分類再編で構築した系統樹 (家系図のようなもの)。

用語解説

(※1) 門
生物の分類階級は、上位より界、門、綱、目、科、属、種などに分けられる。例えば、ヒトの分類は、動物界、脊索動物門(セキツイ動物亜門)、哺乳綱、サル目、ヒト科、ヒト属、ヒトとなり、綱の階級は脊索動物門の高いレベルである。細菌では界がないため、門が最上位の階級である(現時点でおよそ35の門がある)。

参考資料

2014年にサハラ砂漠から発見された細菌の顕微鏡写真。
この細菌(オリゴフレクスス・チュニジエンシス)の発見を機に、この基準株を代表とする新しい分類群(オリゴフレキシア綱)が提案された。左下の黒い線の長さは0.01ミリメートルである。

論文情報

  • 掲載誌: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology(IJSEM)
  • 論文タイトル: Proposal to reclassify the proteobacterial classes Deltaproteobacteria and Oligoflexia, and the phylum Thermodesulfobacteria into four phyla reflecting major functional capabilities
  • 著者名: David W. Waite, Maria Chuvochina, Claus Pelikan, Donovan H. Parks, Pelin Yilmaz, Michael Wagner, Alexander Loy, Takeshi Naganuma, Ryosuke Nakai, William B. Whitman, Martin W. Hahn, Jan Kuever, Philip Hugenholtz
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.004213
【お問い合わせ先】

大学院統合生命科学研究科
教授 長沼 毅
TEL: 090-1187-4587
E-mail: takn*hiroshima-u.ac.jp (注: *は半角@に置き換えてください)

国立研究開発法人 産業技術総合研究所
生物プロセス研究部門
中井亮佑
E-mail:nakai-ryosuke*aist.go.jp (注: *は半角@に置き換えてください)


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